王小敏等研究表明，不同cd污染水平下巨大芽孢杆菌可使土壤中有效态cd含量提高3.8%~24.4%；将其与印度芥菜联合修复土壤cd污染，可使印度芥菜cd含量提高13.9%~96.9% ，印度芥菜地上部cd含量增加42.1%，土壤中可交换态cd含量增加10.7%。杨榕等考察了不同接种量条件下胶质芽孢杆菌对印度芥菜修复cd污染土壤的影响，结果表明，不同浓度的胶质芽孢杆菌可使土壤cd含量降低4.7%~20.9%，同时能提高土壤有效态cd含量15.15%~36.54%，非根际土壤有效态cd含量提高31.73%~45.28%。
直接接触溶藻是芽孢杆菌溶藻的主要方式之一，溶藻过程中，活菌直接进攻宿主裂解藻细胞。从滇池分离的溶藻菌dc23 的纯培养液对于液体培养的蓝藻有很强的溶解作用，而过滤液则不起溶藻效果，属于直接接触溶藻的类型。有些芽孢杆菌同时存在直接和间接两种溶藻方式。纺锤形赖氨酸芽孢杆菌通过分泌胞外非蛋白酶杀藻物质间接溶藻和接触藻细胞直接溶藻两种作用方式发挥溶藻特性，对铜绿微囊藻具有较高的降解率，对于微生物法防治以铜绿微囊藻为优势藻种的蓝藻水华具有较广阔的应用前景。
人们常在池塘养殖鱼类中吃出一股土腥味，这种异味主要是由geosmin 和mib两种化合物引起。鱼类的土腥味常在夏季蓝藻水华时出现，颤藻、鞘丝藻、微囊藻、鱼腥藻等属种是造成土腥味的常见种类。其中微囊藻还可以产生化合物和蒜味化合物，这些物质都是藻类的次级代谢产物，它们通过鱼鳃和皮肤进入鱼体后大量富集，产生异味，严重影响养殖鱼类的销售。

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